Domanda:
Basi di DNA modificate in Pymol e Coot
Rachel W
2015-05-05 05:05:29 UTC
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Quando si utilizza il software di visualizzazione molecolare Pymol o Coot per risolvere strutture cristallografiche a raggi X, come posso mutare una citosina in 5-metilcitosina?

Pymol è uno strumento per la visualizzazione. Non puoi modificare le molecole con esso (come dovrebbe sapere dove posizionare esattamente il gruppo metile?). È necessario modificare il file sorgente delle molecole manualmente o con un altro strumento.
Una risposta:
Rachel W
2015-05-07 02:05:30 UTC
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Ho ottenuto la risposta su un listserve Pymol:

Sì, può essere fatto in Pymol.

Scegli il residuo che vuoi mutare dalla citosina alla 5-metilcitosina. Azione - Idrogeni - Funzione Aggiungi per aggiungere idrogeni. Modifica la selezione del mouse per scegliere gli atomi.

Fai clic sull'idrogeno che desideri sostituire.

Fai clic su Builder (c'è ancora del lavoro da fare se sei su un Mac, vedi sotto) per aprire la finestra del builder.

Fai clic su C

Se sei su un Mac, non avrai la funzionalità Builder a meno che non modifichi il nome del tuo file MacPyMOL.app in PyMOLX11Hybrid.app



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Questa domanda e risposta è stata tradotta automaticamente dalla lingua inglese. Il contenuto originale è disponibile su stackexchange, che ringraziamo per la licenza cc by-sa 3.0 con cui è distribuito.
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