Domanda:
Immagine della struttura cristallina
Ben
2017-12-24 20:09:25 UTC
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Esistono siti Web o risorse in cui posso ottenere una buona immagine di una determinata struttura cristallina? Nel mio caso sto cercando piombo (II) tungstato $ \ ce {PbWO4} $ e non riesco a trovare una grafica vivida su Google (ad eccezione della formula strutturale).

Ho visto modellazione della struttura dei cristalli, ma sfortunatamente il software è commerciale.

Due risposte:
andselisk
2017-12-24 20:15:10 UTC
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Consiglio di recuperare le strutture cristalline dei composti inorganici tramite uno specifico modello di ricerca di Google site: Crystallography.net <keyword (s) > , ad es. nel tuo caso

site: crystallography.net PbWO4

restituisce questa pagina COD dove puoi usare JSmol per fare le basi visualizzazione direttamente nel tuo browser web. In alternativa, puoi scaricare CIF e lavorare ulteriormente offline con numerosi strumenti gratuiti come Mercury o Olex2. Entrambi sono gratuiti e disponibili per Windows, Linux e MacOS.

Mercury

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Olex2

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Grazie! L'immagine fornita non sembra così buona. L'obiettivo è avere un'immagine di alta qualità per la mia tesi. C'è qualcosa che corrisponde ai miei interessi?
@Ben L'immagine a cui ti riferisci è quella generata dallo script JSmol, che è molto configurabile in termini di visualizzazione. Leggi il [manuale di JSmol] (http://wiki.jmol.org/index.php/JSmol) se vuoi saperne di più. Lo stesso per le app desktop, non esiste un modo semplice per aggirare.
Ah, scusa, gli altri due strumenti forniscono una bella grafica. Li darò un'occhiata! Grazie!
@Ben Nessun problema, ma come ho detto, devi prima leggere i manuali e ci vorrà del tempo (una sera, forse un paio). La "bellezza" di JSmol è che puoi facilmente vedere direttamente nel tuo browser se questa è la struttura che desideri o meno senza noiosi scaricare e aprire i file CIF sul computer :)
Grazie, puoi forse consigliare un certo stile di disegno? La mia tesi riguarda la fisica delle particelle e voglio solo "mostrare" il materiale che stiamo usando per rilevare le particelle. Ciò significa che si tratta effettivamente di più (semplice) visualizzazione e meno di informazioni specifiche.
@Ben Questo è ampio e non c'è una buona risposta. Ti consiglio di dare un'occhiata alle recenti pubblicazioni correlate nel tuo campo e di attenersi a ciò che hanno fatto gli altri per mostrare le loro strutture. IMO in chimica inorganica ha senso mostrare la cella unitaria piena e disegnare poliedri di coordinazione per gli atomi di interesse se lo si desidera (Mercurio non può farlo BTW, Olex2 può), quindi mostrare poche proiezioni. Le immagini devono essere semplici, chiare e supportare la tua tesi; non sono lì per essere belli, devono essere istruttivi in ​​primo luogo.
Gli strumenti sembrano richiedere uno sforzo eccessivo per i miei scopi reali. Ma ad esempio, Diamond crea direttamente una bella immagine. Certo le informazioni sono più importanti della grafica stessa, ma non siamo chimici (o qualcosa di simile).
Anche @Ben Diamond ha bisogno di molte modifiche, non esiste un programma che ti dia esattamente quello che vuoi perché non esiste ancora un'interfaccia telepatica. Sì, Diamond è un po 'più facile, ma probabilmente è l'unico vantaggio; funziona solo su Windows, memorizza le strutture nel proprio formato proprietario (`diamdoc`), si blocca molto e costa un sacco di soldi.
Sì, è giusto. Ho ottenuto un'immagine perfetta subito dopo l'importazione, poi ho cliccato da qualche parte e ora non posso più usarla .. ma Vesta sembra corrispondere ai miei interessi. Probabilmente anche il mercurio e l'ossido vanno bene, ma voglio solo un'immagine e due settimane di sforzo perché non ne vale la pena (per i miei scopi).
Shiv Upadhyay
2017-12-25 05:09:28 UTC
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Seguo metodi simili come menzionato sopra. Per prima cosa, individua il file CIF come descritto sopra.

Uso VESTA che è un programma di visualizzazione molecolare gratuito e multipiattaforma. È relativamente facile ricavarne un'immagine decente (File> Esporta immagine raster):

enter image description here

Puoi persino rendere immagini vettoriali! Hai relativamente poco controllo sullo stile dell'immagine, ma funziona bene per le immagini di base. Di solito mi ritrovo solo a modificare la lucentezza degli atomi e dei legami (Oggetti> Proprietà> Atomi).

Oh, in realtà mi sono dimenticato di questa gemma, risposta molto bella! Probabilmente potresti aggiungere che VESTA è anche gratuito (come birra) ed è multipiattaforma :)


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Questa domanda e risposta è stata tradotta automaticamente dalla lingua inglese. Il contenuto originale è disponibile su stackexchange, che ringraziamo per la licenza cc by-sa 3.0 con cui è distribuito.
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